F. Miranda Soares (Filipi)

Ph.D. Researcher at the Center for Artificial Intelligence (C4AI) at the University of São Paulo, Brazil. Guest Ph.D. Candidate in Computer Science at the University of Twente, the Netherlands. Master's degree in Knowledge Management and Organization (2019). Bachelor in Library Science from the Federal University of Minas Gerais, Brazil (2017), and was an Erasmus student at the Polytechnic Institute of Porto, Portugal (2016-2017). Works on topics related to linked data, controlled vocabularies for the Semantic Web, metadata standards, management of scientific data, the FAIR Data Principles, and other related topics. Domains of application: biodiversity (focused on biological interactions, such as pollination, that can benefit sustainable agriculture somehow), agriculture, agrobiodiversity, and agroecology.

Faculty of Electrical Engineering, Mathematics and Computer Science (EEMCS), Semantics, Cybersecurity & Services (SCS)

One of the main characteristics of the big data paradigm is the unstructured way in which data are published. Big data applications have great potential to be used in digital agriculture, but one may find it difficult to work with unstructured data since most datasets do not provide an accurate description of the data semantics, hampering interpretation and reuse. Consequently, semantic interoperability between datasets may be jeopardized, since the datasets do not share the same metadata concepts in their records. To address that problem, this research project proposes the development of metadata models for the semantic interoperability of datasets in the agricultural domain, focusing on the subdomain of agricultural commodities. To achieve our research objective, the Design Science research principles are adopted as the methodological approach, since it allows the development of research artifacts for the purpose of acquiring knowledge. Two main artifacts are going to be created: 1) a metadata schema for the domain; 2) a metadata semantic mapping among different schemas. The first artifact aims at the publication of agricultural commodities data as semantically structured data, and the second artifact aims at enabling interoperability among datasets by establishing a semantic equivalence between metadata terms used in each dataset. In the last stage of the research, the general applicability of the proposed metadata models will be challenged by applying them in another related field, namely food and nutrition. Finally, the metadata schema will be validated by domain specialists.

Saraiva, A. M., Osório, F. S., Colaço, A. F., Drucker, D. P., Mendiondo, E. M., Corrêa, F. E. , Soares, F. M., Molin, J. P., Benso, M. R., Marques, P. A. A., Silva, R. F. D., Miranda, S. H. G. D., Costa, W. F., & Delbem, A. C. B. (2024). A inteligência artificial na pesquisa agrícola. Revista Universidade de São Paulo, 2024(141). https://doi.org/10.11606/issn.2316-9036.i141p91-106

Miranda Soares, F., Saraiva, A. M., Rangel Silva, R. , Ferreira Pires, L., Ghilardi-Lopes, N. P., Montedo, U. B., Moreira dos Santos Maculan, B. C., Martins de Carvalho, A., Koffler, S., Souza, T., Coradin, L., Pignatari Drucker, D., Santiago, R., Garcia, M. C., Bouzembrak, Y. , Gavai, A., & Lanza, T. (2024). Fruits of Collaboration: the contribution of the ‘Pomar Urbano’ initiative in promoting the monitoring, conservation, and use of fruit-bearing plants in Brazilian cities. Poster session presented at 2024 Planetary Health Summit & 6th Annual Meeting, Petaling Jaya, Malaysia.

Pignatari Drucker, D., Salim, J. A., Poelen, J. , Soares, F. M., Gonzalez-Vaquero, R. A., Devoto, M., Ollerton, J., Kasina, M., Carvalheiro, L. G., Bergamo, P. J., Alves, D. A., Varassin, I., Tinoco, C. F., Rünzel, M., Robinson, D., Cardona-Duque, J., Idárraga, M., Agudelo-Zapata, M. C., Herrera, E. M., ... Saraiva, A. (2024). WorldFAIR (D10.3) Agricultural biodiversity FAIR data assessment rubrics. https://doi.org/10.5281/zenodo.10719265

Soares, F. M. , Ferreira Pires, L., Garcia, M. C., Bouzembrak, Y., Coradin, L., Ghilardi-Lopes, N. P., Rangel Silva, R., Martins de Carvalho, A., Moreira dos Santos Maculan, B. C., Koffler, S., Montedo, U. B., Pignatari Drucker, D., Santiago, R. , Gavai, A., Peres de Carvalho, M. C., da Silva Lima, A. C., Elias Gabriel, H. D., Mendonça de França, S. G., Reis de Almeida, K., ... Saraiva, A. M. (2024). Leveraging citizen science for monitoring urban forageable plants. GigaScience, 13, 1-3. Article giae007. https://doi.org/10.1093/gigascience/giae007

Drucker, D., Salim, J. A., Poelen, J. , Soares, F. M., Gonzalez-Vaquero, R. A., Ollerton, J., Devoto, M., Rünzel, M., Robinson, D., Kasina, M., Taliga, C., Parr, C., Cox-Foster, D., Hill, E., Maues, M. M., Saraiva, A. M., Agostini, K., Carvalheiro, L. G., Bergamo, P., ... Trekels, M. (2024). WorldFAIR (D10.2) Agricultural Biodiversity Standards, Best Practices and Guidelines Recommendations. https://doi.org/10.5281/ZENODO.10666593

Soares, F. M. , Pires, L. F., Garcia, M. C., Coradin, L., Ghilardi-Lopes, N. P., Silva, R. R., Martins de Carvalho, A. , Gavai, A., Bouzembrak, Y., Moreira dos Santos Maculan, B. C., Koffler, S., Montedo, U. B., Pignatari Drucker, D., Santiago, R., Carvalho, M. C. P. D., da Silva Lima, A. C., Elias Gabriel, H. D., Mendonça de França, S. G., Reis de Almeida, K., ... Saraiva, A. M. (2024). Citizen science data on urban forageable plants: a case study in Brazil. GigaByte. https://doi.org/10.46471/gigabyte.107

Miranda Soares, F. , Ferreira Pires, L., Garcia, M. C., Coradin, L., Ghilardi-Lopes, N. P., Rangel Silva, R., Martins de Carvalho, A. , Gavai, A., Bouzembrak, Y., Moreira dos Santos Maculan, B. C., Koffler, S., Montedo, U. B., Pignatari Drucker, D., Santiago, R., de Carvalho, M. C., da Silva Lima, A. C., Elias Gabriel, H. D., Mendonça de França, S. G., Reis de Almeida, K., ... Saraiva, A. M. (2024). Citizen Science Data on Urban Forageable Plants: A Case Study in Brazil. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2024.01.22.575882

Drucker, D., Cruz, S., Telles, M., Ferreira, A., Corrêa, F., Bertin, P., Marassi, L., Aquino, K., Bezerra, G., Cruz, P. , & Miranda Soares, F. (2023). Desdobramentos da Implementação da Rede GO FAIR Agro Brasil no Biênio 2021-2023. In Proceedings of the 14th Brazilian Congress of Agroinformatics https://doi.org/10.5753/sbiagro.2023.26570

Mendes, C., Correa, F., Drucker, D. , Miranda Soares, F., Saraiva, A., Delbem, A., Osório, F., Oliveira, C., & Maranhão, J. (2023). Governança de dados na agricultura digital: relato da experiência do C4AI. In Proceedings of the 14th Brazilian Congress of Agroinformatics https://doi.org/10.5753/sbiagro.2023.26559

Guizzardi, R., Faron, C. , Miranda Soares, F. , & Sedrakyan, G. (2023). SmartFood: 1st Workshop on Controlled Vocabularies and Data Platforms for Smart Food Systems. In Advances in Conceptual Modeling: ER 2023 Workshops, CMLS, CMOMM4FAIR, EmpER JUSMOD, OntoCom, QUAMES, and SmartFood Lisbon, Portugal, November 6–9, 2023 Proceedings (1 ed., pp. 295-297). (Lecture Notes in Computer Science; Vol. 14319). Springer Nature.

Soares, F. M., Correa, F. E., Pires, L. F., Santos, L. O. B. da S., Drucker, D. P., Braghetto, K. R., et al. (2022). Building a community-based FAIR metadata schema for Brazilian agriculture and livestock trading data. In SEMANTICS 2022 EU: 18th International Conference on Semantic Systems, Vienna, 2022. https://ceur-ws.org/Vol-3235/paper26.pdf

Soares, F. M., Hamanaka, R. Y., Pontes, T. C. F., Araújo, W. J., & Maculan, B. C. M. dos S. (2022). A aplicação do método de análise de conteúdo na ciência da informação: um estudo preliminar no contexto das teses e dissertações da UFMG. Revista Ibero-Americana De Ciência Da Informação, 15(2), 327–350. https://doi.org/10.26512/rici.v15.n2.2022.36060

Drucker DP, Salim JA, Trekels M, Groom Q, Parr C, Soares FM, Agostini K, Saraiva AM, Molloy L, Hodson S, Gregory A (2022) Plant-pollinator Interaction Data: A case study of the WorldFAIR project. Biodiversity Information Science and Standards 6: e94310. https://doi.org/10.3897/biss.6.94310

José A Salim, Antonio M Saraiva, Paula F Zermoglio, Kayna Agostini, Marina Wolowski, Debora P Drucker, Filipi M Soares, Pedro J Bergamo, Isabela G Varassin, Leandro Freitas, Márcia M Maués, Andre R Rech, Allan K Veiga, Andre L Acosta, Andréa C Araujo, Anselmo Nogueira, Betina Blochtein, Breno M Freitas, Bruno C Albertini, Camila Maia-Silva, Carlos E P Nunes, Carmen S S Pires, Charles F dos Santos, Elisa P Queiroz, Etienne A Cartolano, Favízia F de Oliveira, Felipe W Amorim, Francisco E Fontúrbel, Gleycon V da Silva, Hélder Consolaro, Isabel Alves-dos-Santos, Isabel C Machado, Juliana S Silva, Kátia P Aleixo, Luísa G Carvalheiro, Márcia A Rocca, Mardiore Pinheiro, Michael Hrncir, Nathália S Streher, Patricia A Ferreira, Patricia M C de Albuquerque, Pietro K Maruyama, Rafael C Borges, Tereza C Giannini, Vinícius L G Brito, Data standardization of plant–pollinator interactions, GigaScience, Volume 11, 2022, giac043, https://doi.org/10.1093/gigascience/giac043

Sheina Koffler, Filipi Miranda Soares, Natalia Pirani Ghilardi-Lopes, Bruno Albertini, Debora Pignatari Drucker, José Augusto Salim, Patricia Nunes-Silva, Tiago Mauricio Francoy, Antonio Mauro Saraiva, & Claire Carvell. (2022). FIT Count Brasil: monitoramento de visitantes florais por contagem (p. 90). UFABC. https://doi.org/10.5281/zenodo.6419201

Sheina Koffler, Filipi Miranda Soares, Natália Pirani Ghilardi-Lopes, Bruno Albertini, Debora P Drucker, José Augusto Salim, Patrícia Nunes-Silva, Tiago Mauricio Francoy, Antonio Mauro Saraiva, Claire Carvell. FIT Count Brasil: aplicativo para monitoramento de polinizadores. In: Anais do II Workshop da Rede Brasileira de Ciência Cidadã. Anais...São Paulo(SP) online, RBCC, 2022. https://doi.org/10.29327/175207.1-1

A. M. SARAIVA, B. C. ALBERTINI, C. ULSEN, D. VIANNA, D. MIRANDA, F. XAVIER, F. M. SOARES, G. R. BORGES, G. MACHADO, J. A. B. GRIMONI, J. OKAMOTO JR, L. ERMILIVITCH, M. L. VEGA, M. V. B. OKUYAMA, M. M. SECKLER, M. R. MAURO, M. C. S. PEREIRA, M. A. SIMPLICIO JUNIOR, N. A. CARMO, R. C. PUGLISI, R. SCARATI, T. C. M. CARVALHO, A. C. B. DELBEM, U. B. MONTEDO, W. F. COSTA, C. PARANAIBA, E. L. COELHO, R. SANTIAGO, T. S. CAMARGO. Planetary Health in Engineering: building a community. In 2022 Planetary Health Annual Meeting, Boston, 2022. https://www.researchgate.net/publication/364806693_Planetary_Health_in_Engineering_building_a_community

F. M. SOARES, S. KOFFLER, N. P. GHILARDI-LOPES, B. ALBERTINI, P. N. SILVA, DEBORA DRUCKER, C. CARVELL, J. CHIAZZESE, J. A. SALIM, T. M. FRANCOY, A. M. SARAIVA. Monitoring pollinators in Brazil: the challenge of adapting the FIT Count citizen science protocol to the Brazilian context. In 2022 Planetary Health Annual Meeting, Boston, 2022. https://www.researchgate.net/publication/364807317_Monitoring_pollinators_in_Brazil_the_challenge_of_adapting_the_FIT_Count_citizen_science_protocol_to_the_Brazilian_context

N. P. GHILARDI-LOPES, E. ZATTARA, K. AGOSTINI, T. M. FRANCOY, F. E. FONTURBEL, B. BLOCHTEIN, S. KOFFLER, F. M. SOARES, C. BARBIERI, A. M. SARAIVA. Citizen science and pollinators of South America. In ECSA Conference 2022: Citizen science for planetary health, Berlin, 2022. https://www.researchgate.net/publication/364806027_Citizen_science_and_pollinators_of_South_America

Koffler, Sheina, Acosta, Andre Luis, Soares, Filipi Miranda, & Saraiva, Antonio Mauro. (2022). 2021 Planetary Health Annual Meeting and Festival Book of Abstracts: Planetary Health for All: Bridging Communities to Achieve the Great Transition (p. 199). Institute of Advanced Studies of the University of São Paulo; Planetary Health Alliance. https://doi.org/10.5281/zenodo.6373367

Carvell, C. & Chiazzese, Jim & Zattara, Eduardo & Fontúrbel, Francisco & Muschett, Giselle & Ghilardi-Lopes, Natalia & Soares, Filipi. (2022). Monitoreo de visitas florales mediante el Conteo Cronometrado de Visitantes Florales (FIT Count). https://doi.org/10.4322/978-65-86819-21-2.s03c14.es

Carvell, C. & Chiazzese, Jim & Zattara, Eduardo & Fontúrbel, Francisco & Muschett, Giselle & Ghilardi-Lopes, Natalia & Soares, Filipi. (2022). Monitoramento da visitação de flores com Contagem Cronometrada de Visitantes Florais (FIT Count). https://doi.org/10.4322/978-65-86819-20-5.s03c14.pt.

Soares, Filipi Miranda and Hamanaka, Raíssa Yuri Aplicação de metadados na padronização de registros de ocorrência de espécies no contexto da ciência cidadã para a biodiversidade: um estudo de caso., 2021 . In Organização do Conhecimento no Horizonte 2030: Desenvolvimento Sustentável e Saúde / coord. por Carlos Guardado da Silva, Jorge Revez, Luis Corujo, 2021, ISBN 978-989-566-137-4. https://dialnet.unirioja.es/servlet/articulo?codigo=8411215

Corrêa, Pedro & Brandão, Anarosa & Júnior, Jorge & Almeida, Felipe & Soares, Filipi & Kimura, Leonardo & Tabuti, Lucy & Vellenich, Danton & Raimundo Mendes, Nilton Paulo & de Souza, Douglas & Ohara, Mauro & Badiali, Ana & Leone, Mariza & Carmo, Nilton & Rosa, Suzano & Chavez, Michelet & Matos, Rafael. (2021). Anais do X Workshop de Pós- Graduação de Engenharia da Computação.https://doi.org/10.5281/zenodo.5675699 .

SOARES, F. M.; HAMANAKA, R. Y.; MACULAN, B. C. M. D. S. Interoperabilidade semântica no contexto de dados da biodiversidade: um estudo de caso sobre a utilização de padrões de metadados. In Encontro Nacional de Pesquisa e Pós-graduação em Ciência da Informação, 21., 2021, Rio de Janeiro. http://hdl.handle.net/20.500.11959/brapci/192460

Salim JA, Zermoglio PF, Drucker DP, Soares FM, Saraiva AM, Agostini K, Freitas L, Wolowski M, Rech AR, Maués MM, Varassin IG (2021) Plant-pollinator Vocabulary - a Contribution to Interaction Data Standardization. Biodiversity Information Science and Standards 5: e75636. https://doi.org/10.3897/biss.5.75636

Soares, F. M., B. C. M. dos S. Maculan, D. P. Drucker, e A. M. Saraiva. “Methodological Principles to Create a Metadata Extension to the Darwin Core Standard for Agrobiodiversity Data”. Brazilian Journal of Information Science: Research Trends, vol. 14, nº 4 - out-dez, dezembro de 2020, p. e020015, doi:10.36311/1940-1640.2020.v14n4.10865.

Soares FM, Saraiva AM, Drucker DP (2020) Linking Agrobiodiversity Data through Metadata Standards. Biodiversity Information Science and Standards 4: e58928. https://doi.org/10.3897/biss.4.58928

MOREIRA, C.; SOARES, F. M. .; HAMANAKA, R. Y.; BUENO, R. V. .; AGANETTE, E. C. . Produtos da Ciência da Informação para o processo de doação de bens permanentes em Instituições Públicas: o caso do projeto Motirõ. Múltiplos Olhares em Ciência da Informação, [S. l.], v. 10, 2020. DOI: 10.35699/2237-6658.2020.20344. Disponível em: https://periodicos.ufmg.br/index.php/moci/article/view/20344.

SOARES , F. M. .; MACULAN , B. C. .; DRUCKER, D. . P. . Padrão de metadado Darwin Core: Proposta de extensão para as interações ecológicas no contexto da agrobiodiversidade. Múltiplos Olhares em Ciência da Informação, [S. l.], v. 9, n. 2, 2020. Disponível em: https://periodicos.ufmg.br/index.php/moci/article/view/19179.

Miranda Soares, F. (2019). Aplicação do software Open Monograph Press para criação de uma biblioteca digital de monografias de uma instituição de ensino superior. LIBERTAS: Revista De Ciênciais Sociais Aplicadas, 9(2), 28-52. Recuperado de https://famigvirtual.com.br/famig-libertas/index.php/libertas/article/view/244

Miranda Soares, F., Coura Moreira dos Santos Maculan, B., & Mendonça Oliveira, L. H. (2019). Criação de tesauro em software especializado. LIBERTAS: Revista De Ciênciais Sociais Aplicadas, 9(1), 174-189. Recuperado de https://famigvirtual.com.br/famig-libertas/index.php/libertas/article/view/239

Hamanaka, Raíssa Yuri, & Soares, Filipi Miranda. (2019). A relação entre o mapeamento de processos e a modelização no contexto da gestão do conhecimento: estudo de caso aplicado em uma biblioteca digital. Investigación bibliotecológica, 33(81), 223-240. Epub 21 de abril de 2020.https://doi.org/10.22201/iibi.24488321xe.2019.81.57997

Soares FM, Maculan BCMS, Drucker D (2019) Darwin Core for Agricultural Biodiversity: A metadata extension proposal. Biodiversity Information Science and Standards 3: e37053. https://doi.org/10.3897/biss.3.37053

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